分子病理實(shí)驗(yàn)室裝修、設(shè)計(jì)建設(shè)
國(guó)家衛(wèi)計(jì)委2014年發(fā)布的《臨床實(shí)驗(yàn)室生物安全指南》中指出,臨床實(shí)驗(yàn)室應(yīng)參照二級(jí)生物安全實(shí)驗(yàn)室(BSL-2)實(shí)現(xiàn)分區(qū)及分流。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)根據(jù)自身需求,以“各區(qū)獨(dú)立,防止污染”為原則,增減各功能區(qū)。分子病理實(shí)驗(yàn)室的污染分為生物污染和核酸污染,生物污染主要是在處理體液樣本的區(qū)域,而核酸污染主要在核酸提取、擴(kuò)增和分析的區(qū)域。據(jù)此,應(yīng)將實(shí)驗(yàn)室劃分為以生物污染對(duì)象的生物污染區(qū)、生物半污染區(qū)和生物潔凈區(qū),也可以將實(shí)驗(yàn)室劃分為以核酸污染對(duì)象的核酸污染區(qū)、核酸半污染區(qū)和核酸潔凈區(qū)。
一、實(shí)驗(yàn)室區(qū)域按照其功能可以分為實(shí)驗(yàn)功能區(qū)、實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備區(qū)和辦公區(qū)。
(一)實(shí)驗(yàn)功能區(qū):以Illumina二代測(cè)序平臺(tái)為例,按照實(shí)驗(yàn)流程將實(shí)驗(yàn)功能區(qū)劃分:
1、樣本接收區(qū):
接收臨床送檢的體液及石蠟樣本,核對(duì)患者信息,對(duì)所接收的樣本進(jìn)行登記編號(hào),體液樣本置于4℃保存,及時(shí)處理。
2、樣本前處理區(qū)
用于組織切片、脫蠟、染色及血液、尿液、胸腹水等標(biāo)本的離心、涂片、染色等。
3、試劑暫存及準(zhǔn)備區(qū)
試劑暫存區(qū)需配備4℃和-20℃以下冰箱,按照試劑儲(chǔ)存條件分別儲(chǔ)存,并記錄使用情況。
4、樣本制備區(qū)
石蠟樣本癌組織的富集、樣本的消化、DNA和RNA的提取及OD值的測(cè)定。該區(qū)域安置外排式二級(jí)生物安全柜,降低實(shí)驗(yàn)過(guò)程中產(chǎn)生的有害氣溶膠對(duì)實(shí)驗(yàn)人員和環(huán)境的危害。
5、核酸片段化區(qū)
樣本核酸的打斷。該區(qū)域可能產(chǎn)生核酸氣溶膠,屬于核酸污染區(qū)。
6、PCR擴(kuò)增一區(qū)(第1次PCR擴(kuò)增)
7、產(chǎn)物分析區(qū)
對(duì)PCR產(chǎn)物或打斷后的核酸進(jìn)行電泳檢測(cè)。核酸片段化分為機(jī)械打斷和酶消化打斷,機(jī)械打斷后需要對(duì)產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測(cè),評(píng)估核酸片段化狀態(tài),屬于核酸污染區(qū)。
8、純化一區(qū)
第1次PCR產(chǎn)物純化、第1次雜交、第1次捕獲、第2次雜交、第2次捕獲及捕獲樣本純化,屬于核酸污染區(qū)。
9、PCR擴(kuò)增二區(qū)(第2次PCR擴(kuò)增)
10、純化二區(qū)
第2次PCR產(chǎn)物純化及文庫(kù)檢測(cè),同純化一區(qū)。
11、測(cè)序區(qū)
放置測(cè)序儀,進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。該區(qū)域自身不產(chǎn)生核酸氣溶膠,但需要采取防止被氣溶膠污染的措施,屬于核酸半污染區(qū)。
12、數(shù)據(jù)分析區(qū)
數(shù)據(jù)處理分析,結(jié)果解讀及報(bào)告打印。該區(qū)域自身不產(chǎn)生核酸氣溶膠,屬于核酸半污染區(qū)。
(二)實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備區(qū)
1、高溫滅菌室
高溫滅菌室配備高壓蒸汽滅菌器和高溫烘箱,設(shè)備功率較高,需單獨(dú)線(xiàn)路配電。因高壓蒸汽設(shè)備,該區(qū)域空氣交換12次/h。
2、危險(xiǎn)品倉(cāng)庫(kù)
該區(qū)域應(yīng)遠(yuǎn)離實(shí)驗(yàn)室和辦公區(qū),安全出口通暢。對(duì)于有腐蝕性、易燃易爆性的試劑,采取防腐防爆和通風(fēng)措施。
3、一般倉(cāng)庫(kù):存放移液器吸頭、離心管等
4、試劑儲(chǔ)存間
試劑儲(chǔ)存分為室溫儲(chǔ)存(18℃-26℃)、冷藏儲(chǔ)存(2℃-8℃)和冷凍儲(chǔ)存(-20℃以下)。
(三)辦公區(qū)
該區(qū)域主要用于實(shí)驗(yàn)人員工作、學(xué)習(xí)、休息場(chǎng)所,為潔凈區(qū),需要遠(yuǎn)離生物污染區(qū)和危險(xiǎn)品倉(cāng)庫(kù)。
二、氣流流向
為防止核酸氣溶膠污染,各功能區(qū)需安裝獨(dú)立的通風(fēng)系統(tǒng),密封,不得交叉通風(fēng),避免
交叉污染。對(duì)于實(shí)驗(yàn)室通風(fēng),氣流宜采用上送下排方式,送風(fēng)口和排風(fēng)口布置應(yīng)有利于室內(nèi)可能被污染空氣的排出,在生物安全柜操作面或其他有氣溶膠產(chǎn)生的地點(diǎn)上方附近不應(yīng)設(shè)置送風(fēng)口。各區(qū)域空氣交換12次/h~16次/h。實(shí)驗(yàn)室亦可采取窗戶(hù)進(jìn)行自然通風(fēng),但需設(shè)防蟲(chóng)紗窗和防節(jié)肢動(dòng)物設(shè)施。有條件的實(shí)驗(yàn)室可安裝負(fù)壓裝置,功能區(qū)內(nèi)氣壓(負(fù)壓)與室外大氣壓的壓差值應(yīng)>30Pa,與相鄰區(qū)域的壓差(負(fù)壓)應(yīng)>10Pa
三、溫濕度控制
測(cè)序區(qū)、PCR擴(kuò)增一區(qū)和二區(qū)等放置大型精密儀器的區(qū)域應(yīng)恒溫恒濕,相對(duì)濕度宜控制在30%~70%范圍內(nèi)。溫度宜控制在18℃~26℃范圍內(nèi),2h內(nèi)溫度波動(dòng)應(yīng)<2℃,避免環(huán)境因素影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
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