NGS實(shí)驗(yàn)室裝修、設(shè)計(jì)建設(shè)
NGS實(shí)驗(yàn)室又叫高通量測(cè)序檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室。NGS是下一代測(cè)序技術(shù)( Next Generation Sequencing)即高通量測(cè)序技術(shù)的簡(jiǎn)稱。高通量測(cè)序技術(shù)是對(duì)傳統(tǒng)Sanger測(cè)序(稱為一代測(cè)序技術(shù))革命性的改變, 可同時(shí)對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸分子進(jìn)行序列測(cè)定,同時(shí)高通量測(cè)序使得對(duì)一個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌的分析成為可能,也稱為深度測(cè)序(Deep sequencing)。
一、實(shí)驗(yàn)室空間設(shè)計(jì)
NGS實(shí)驗(yàn)室需要設(shè)有準(zhǔn)備樣本、提取DNA/RNA、建庫(kù)、測(cè)序等多個(gè)區(qū)域,這些區(qū)域需要根據(jù)工作流程合理布局,確保不同步驟之間不會(huì)相互干擾。另外,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)人員數(shù)量和設(shè)備配置合理設(shè)計(jì)大小,確保實(shí)驗(yàn)室的通風(fēng)和安全性。
1、試劑準(zhǔn)備室主要功能:在NGS過(guò)程中使用到的試劑的配制、分裝和保存。
2、標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)主要功能:血液處理、血漿制備、DNA提取、DNA片段化、DNA樣品的純化、DNA濃度檢測(cè)、末端修復(fù)、接頭連接、構(gòu)建樣本的測(cè)序文庫(kù)。
3、文庫(kù)擴(kuò)增與檢測(cè)區(qū)主要功能:文庫(kù)構(gòu)建后的PCR擴(kuò)增與純化、文庫(kù)濃度檢測(cè)、文庫(kù)的混合及混合后的質(zhì)檢分析。
4、測(cè)序區(qū)主要功能:測(cè)序模板制備(乳液PCR與磁珠富集回收)、上機(jī)測(cè)序、數(shù)據(jù)分析、報(bào)告審核及發(fā)放。
二、設(shè)備配置和使用
NGS實(shí)驗(yàn)室需要配備測(cè)序儀器、建庫(kù)儀器、PCR儀器、冷凍保存設(shè)備等多種設(shè)備,這些設(shè)備應(yīng)該根據(jù)實(shí)驗(yàn)工作流程的需要合理配置,并且設(shè)備之間應(yīng)該有足夠的間距以便于維護(hù)和操作。
1、試劑準(zhǔn)備室
主要儀器設(shè)備:加樣器、冰箱、分析天平、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、可移動(dòng)紫外燈和超凈工作臺(tái)等。
2、標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)
主要儀器設(shè)備:冷凍離心機(jī)、微量臺(tái)式離心機(jī)、掌上三管離心機(jī)、渦旋震蕩器、垂直混合儀、移液器、可移動(dòng)紫外燈、生物安全柜、冰箱、托盤(pán)天平、Qubit 2.0核酸定量?jī)x、電腦(可連接互聯(lián)網(wǎng))、條形碼打印機(jī)、普通打印機(jī)、掃描槍、磁力架等。
3、文庫(kù)擴(kuò)增與檢測(cè)區(qū)
主要儀器設(shè)備:PCR儀、QPCR儀、Qubit2.0核酸定量?jī)x、可移動(dòng)紫外燈、超凈工作臺(tái)、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等。
4、測(cè)序區(qū)
主要儀器設(shè)備:高通量測(cè)序儀、PC電腦、打印機(jī)、UPS、恒溫金屬浴、純水儀、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、超凈工作臺(tái)、可移動(dòng)紫外燈、磁力架、PCR儀等。
三、安全性
NGS實(shí)驗(yàn)室應(yīng)該遵守生物安全法規(guī),配備相應(yīng)的生物安全柜、紫外線消毒設(shè)備、生物廢棄物收集設(shè)施等,確保實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的生物風(fēng)險(xiǎn)得到控制。
四、通風(fēng)與空調(diào)
NGS實(shí)驗(yàn)室需要考慮通風(fēng)和空調(diào)系統(tǒng)的設(shè)計(jì),以確保實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的溫度、濕度、潔凈度等參數(shù)符合要求。同時(shí),實(shí)驗(yàn)室通風(fēng)系統(tǒng)應(yīng)該能夠控制實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的有害氣體和粉塵,避免污染實(shí)驗(yàn)樣本。
分區(qū) |
壓力 |
溫度 |
相對(duì)濕度 |
照明 |
專用走廊 |
0Pa |
20-25℃ |
40%~60% |
主實(shí)驗(yàn)室≥300LX,其余房間200~300LX |
緩沖區(qū) |
+5Pa |
|||
試劑準(zhǔn)備室 |
+15Pa |
|||
標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū) |
+10Pa |
|||
文庫(kù)擴(kuò)增與檢測(cè)區(qū) |
-5Pa |
|||
測(cè)序區(qū) |
-10Pa |
五、廢棄物處理
NGS實(shí)驗(yàn)室需要設(shè)立生物廢棄物處理區(qū),將實(shí)驗(yàn)過(guò)程中產(chǎn)生的生物廢棄物進(jìn)行規(guī)范的收集、儲(chǔ)存和處理。
深圳喜格(SICOLAB)經(jīng)過(guò)10多年的技術(shù)沉淀和人才累積,已經(jīng)形成了一個(gè)集實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)規(guī)劃、實(shí)驗(yàn)室改造、實(shí)驗(yàn)室建設(shè)、實(shí)驗(yàn)室裝修的全方位服務(wù),包含實(shí)驗(yàn)室整體工藝方案設(shè)計(jì)施工、實(shí)驗(yàn)室裝飾裝修設(shè)計(jì)施工、實(shí)驗(yàn)室通風(fēng)凈化系統(tǒng)設(shè)計(jì)施工、實(shí)驗(yàn)室水電系統(tǒng)設(shè)計(jì)施工、實(shí)驗(yàn)室用氣系統(tǒng)設(shè)計(jì)施工、實(shí)驗(yàn)室廢水廢氣處理設(shè)計(jì)施工、實(shí)驗(yàn)室家具定制生產(chǎn)安裝于一體的專業(yè)性公司,一直服務(wù)于高校、科研、質(zhì)檢中心、水務(wù)、醫(yī)療衛(wèi)生、食品藥品、環(huán)境監(jiān)測(cè)、檢驗(yàn)檢疫、公安局、法醫(yī)鑒定、第三方檢測(cè)中心等事業(yè)單位和生物制藥企業(yè)、科研機(jī)構(gòu)企業(yè)、石油化工等眾多世界500強(qiáng)企業(yè)。400-8879-829